根據軟件自由法律中心(SFLA)的計算，用戶每購買一份正版Windows，都在替微軟支付21.5美元的所謂“專利費”(patent tax)，然后由微軟支付給持有軟件專利的各大公司。

　　計算的依據是微軟每年都會向其他公司支付1億多美元的法律賠償，以了結35-40％的專利官司。最近比較大額的有：15.2億美元給阿爾卡特-朗訊、12.5億美元給Sun、5.36億美元給Novell、4.4億美元給InterTrust、1.15億美元給z4 Technologies……。在2001-2004年，微軟這方面的累計支出已經高達43億美元。

　　SFLA稱，由于Windows XP系統在同期三年內的銷量約為2億份，所以平均每一份都要承擔21.5美元，而這些最終都是由消費者“買單”的，而北美和歐洲地區的用戶掏得更多。

　　SFLA同時指出，免費、開源的Linux系統就沒有專利稅問題，因此機構組織在考慮部署操作系統的時候都應該將這一點納入考慮范圍。

　　不過需要指出的是，SFLA的結論雖然在一定程度上反應了微軟在專利問題方面的指出，但也有失偏頗。首先，微軟的專利賠償并沒有全部轉移到Windows的成本中，比如Windows XP OEM價格這幾年并沒有上漲，Windows Vista雖然價格較高，但按功能算平均也沒有漲價。微軟的利潤率并不低，其Windows售價也都是根據市場狀況而定，沒必要在這方面挽回法律損失。

　　其次，即使這20多美元的額外成本成立，也不足以動搖用戶對Windows和Linux的選擇，尤其是大家都知道Linux免費Windows收費。很多人離不開Windows的主要原因當然還是第三方軟件的強大支持，這一點正是Linux所無法比擬的。